Để đáp ứng nhu cầu xã hội về nguồn nhân lực có khả năng chuyên môn cao trong lĩnh vực Kỹ thuật máy tính và CNTT-TT, chương trình đào tạo Thạc sĩ Kỹ thuật máy tính được sinh ra nhằm giúp học viên có kiến thức cơ sở và chuyên môn vững vàng, cải thiện khả năng tư duy tổng hợp và hệ thống, tiếp cận, tổ chức và giải quyết tốt những vấn đề khoa học và kỹ thuật liên quan đến lĩnh vực Kỹ thuật máy tính. Hơn hết, học viên sẽ có nhiều cơ hội giao tiếp và làm việc hiệu quả trong nhóm đa ngành và hội nhập được trong môi trường quốc tế, có kiến thức để tiếp tục học ở bậc đào tạo tiến sĩ.
